海慧寺作为寺院建筑，结构完整严谨。沿其中轴线从南往北依次为山门和前殿、中殿、大殿、三大殿及三进院落。山门三间，额匾上写“海慧寺”三字。山门外原有二个大石狮，其上建亭，称为狮子亭。山门内有泥像哼哈二将，高约一丈五尺。进山门即是前院，院内东西两侧建有钟鼓二楼。前殿三间，内有二个佛龛，关帝与韦驮二神像南北相背而立，东西山墙分别立着四大天王。中院有中殿三间，为穿堂式建筑。殿中南向供弥勒佛，靠背北向供观音菩萨。院内各有平顶配房五间。后殿是正殿、即大雄宝殿，面阔五间，进深三间，木结构、砖登顶、是寺内主体建筑，比前殿、中殿都高大宽敞。正中供奉三尊木雕池佛坐像，中间一像是释迦牟尼、俗称西天如来佛。海慧寺后院落两面三刀旁各有小院，以中轴线为准左右对称。西院为大悲阁，东院主体为方丈阁。海慧寺是阳谷现存的古代文化宝贵遗产。